MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 8012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187102	GAG	2	6	1	6	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187102	GGA	2	6	45	50	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187102	TATT	2	8	51	58	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187102	ATT	2	6	95	100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187102	GCT	2	6	111	116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187102	CAA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250064
7	NT_187102	CAAT	2	8	308	315	50 %	25 %	0 %	25 %	409250064
8	NT_187102	CGC	2	6	326	331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250064
9	NT_187102	ATG	2	6	464	469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250064
10	NT_187102	GAT	2	6	473	478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250064
11	NT_187102	TTC	2	6	492	497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250064
12	NT_187102	GC	3	6	602	607	0 %	0 %	50 %	50 %	409250065
13	NT_187102	TGA	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250065
14	NT_187102	ATG	2	6	627	632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250065
15	NT_187102	GTA	2	6	699	704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250065
16	NT_187102	AAT	2	6	791	796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250065
17	NT_187102	ATC	2	6	900	905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250065
18	NT_187102	AAT	2	6	959	964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250065
19	NT_187102	CT	3	6	969	974	0 %	50 %	0 %	50 %	409250065
20	NT_187102	A	6	6	1088	1093	100 %	0 %	0 %	0 %	409250065
21	NT_187102	GTC	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250065
22	NT_187102	TCA	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250065
23	NT_187102	CAT	2	6	1435	1440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250066
24	NT_187102	CGT	2	6	1448	1453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250066
25	NT_187102	GCG	2	6	1491	1496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250066
26	NT_187102	AGC	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250066
27	NT_187102	GCG	2	6	1509	1514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250066
28	NT_187102	CCG	2	6	1527	1532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250066
29	NT_187102	GCA	2	6	1548	1553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250066
30	NT_187102	CT	3	6	1562	1567	0 %	50 %	0 %	50 %	409250066
31	NT_187102	CA	3	6	1585	1590	50 %	0 %	0 %	50 %	409250066
32	NT_187102	TGC	2	6	1605	1610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250066
33	NT_187102	ATC	2	6	1638	1643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250066
34	NT_187102	GCG	2	6	1684	1689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250066
35	NT_187102	ATGA	2	8	1775	1782	50 %	25 %	25 %	0 %	409250066
36	NT_187102	TGA	2	6	1832	1837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250066
37	NT_187102	TTG	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250066
38	NT_187102	CGG	2	6	2008	2013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250066
39	NT_187102	ATC	2	6	2034	2039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250066
40	NT_187102	GCG	2	6	2081	2086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250067
41	NT_187102	GCA	2	6	2103	2108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250067
42	NT_187102	TGGCGC	2	12	2181	2192	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409250067
43	NT_187102	TGATT	2	10	2262	2271	20 %	60 %	20 %	0 %	409250067
44	NT_187102	GATAA	2	10	2323	2332	60 %	20 %	20 %	0 %	409250067
45	NT_187102	AAT	2	6	2359	2364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250067
46	NT_187102	GCC	2	6	2384	2389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250067
47	NT_187102	CAT	2	6	2475	2480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250067
48	NT_187102	ATC	2	6	2483	2488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250067
49	NT_187102	AGA	2	6	2569	2574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187102	CT	3	6	2582	2587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NT_187102	CG	3	6	2660	2665	0 %	0 %	50 %	50 %	409250068
52	NT_187102	T	6	6	2697	2702	0 %	100 %	0 %	0 %	409250068
53	NT_187102	GCT	2	6	2741	2746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250068
54	NT_187102	AC	3	6	2763	2768	50 %	0 %	0 %	50 %	409250068
55	NT_187102	CCG	2	6	2846	2851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250068
56	NT_187102	CCG	2	6	2939	2944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250068
57	NT_187102	CGATG	2	10	2987	2996	20 %	20 %	40 %	20 %	409250068
58	NT_187102	GTCG	2	8	3087	3094	0 %	25 %	50 %	25 %	409250068
59	NT_187102	GAT	2	6	3177	3182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250068
60	NT_187102	GGT	2	6	3195	3200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250068
61	NT_187102	CGC	2	6	3266	3271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250068
62	NT_187102	ATG	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250069
63	NT_187102	GCG	2	6	3593	3598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250069
64	NT_187102	GCC	2	6	3607	3612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250069
65	NT_187102	ATG	2	6	3680	3685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250069
66	NT_187102	CGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250069
67	NT_187102	A	6	6	3742	3747	100 %	0 %	0 %	0 %	409250069
68	NT_187102	CAGC	2	8	3765	3772	25 %	0 %	25 %	50 %	409250069
69	NT_187102	ATG	2	6	3815	3820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250069
70	NT_187102	CAG	2	6	3829	3834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250069
71	NT_187102	TGG	2	6	3846	3851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250069
72	NT_187102	GAA	2	6	3919	3924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250069
73	NT_187102	CG	3	6	3929	3934	0 %	0 %	50 %	50 %	409250069
74	NT_187102	CGC	2	6	4000	4005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250069
75	NT_187102	AAC	2	6	4075	4080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250069
76	NT_187102	T	6	6	4164	4169	0 %	100 %	0 %	0 %	409250069
77	NT_187102	AAC	2	6	4193	4198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250069
78	NT_187102	GGC	2	6	4300	4305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250069
79	NT_187102	TCA	2	6	4347	4352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250069
80	NT_187102	GAC	2	6	4357	4362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250069
81	NT_187102	AGT	2	6	4386	4391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250069
82	NT_187102	ATC	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250069
83	NT_187102	ATC	2	6	4559	4564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250069
84	NT_187102	CGG	2	6	4573	4578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250069
85	NT_187102	GAT	2	6	4690	4695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250069
86	NT_187102	ATG	2	6	4703	4708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250069
87	NT_187102	GCC	2	6	4723	4728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250069
88	NT_187102	GA	3	6	4729	4734	50 %	0 %	50 %	0 %	409250069
89	NT_187102	CGT	3	9	4801	4809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250070
90	NT_187102	CAG	2	6	4820	4825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250070
91	NT_187102	GGC	2	6	4826	4831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250070
92	NT_187102	ACA	2	6	4925	4930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250070
93	NT_187102	TCT	2	6	5032	5037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250070
94	NT_187102	TCA	2	6	5038	5043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250070
95	NT_187102	CAGT	2	8	5115	5122	25 %	25 %	25 %	25 %	409250071
96	NT_187102	TGA	2	6	5250	5255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250071
97	NT_187102	ATT	2	6	5287	5292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250071
98	NT_187102	GGT	2	6	5302	5307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250071
99	NT_187102	GCA	2	6	5319	5324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250071
100	NT_187102	CGG	2	6	5329	5334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250071
101	NT_187102	AGG	2	6	5442	5447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250071
102	NT_187102	CGT	2	6	5486	5491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250071
103	NT_187102	GCG	2	6	5661	5666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250071
104	NT_187102	TTCG	2	8	5706	5713	0 %	50 %	25 %	25 %	409250071
105	NT_187102	GCC	2	6	5887	5892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250071
106	NT_187102	A	6	6	5909	5914	100 %	0 %	0 %	0 %	409250071
107	NT_187102	ATC	2	6	5969	5974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250071
108	NT_187102	CGA	2	6	6012	6017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250071
109	NT_187102	CTG	2	6	6052	6057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250071
110	NT_187102	TGC	2	6	6068	6073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250071
111	NT_187102	A	6	6	6129	6134	100 %	0 %	0 %	0 %	409250071
112	NT_187102	GTG	2	6	6170	6175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187102	A	6	6	6268	6273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187102	CAA	2	6	6353	6358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NT_187102	GAA	2	6	6360	6365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187102	TGG	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250072
117	NT_187102	ATT	2	6	6385	6390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250072
118	NT_187102	ACG	2	6	6400	6405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250072
119	NT_187102	ACA	2	6	6480	6485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250072
120	NT_187102	AGG	2	6	6518	6523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250072
121	NT_187102	GGCG	2	8	6609	6616	0 %	0 %	75 %	25 %	409250072
122	NT_187102	GCC	2	6	6652	6657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250072
123	NT_187102	CTGG	2	8	6669	6676	0 %	25 %	50 %	25 %	409250072
124	NT_187102	TGA	2	6	6725	6730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250072
125	NT_187102	CGGCG	2	10	6742	6751	0 %	0 %	60 %	40 %	409250072
126	NT_187102	ACG	2	6	6875	6880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250072
127	NT_187102	ATT	2	6	6898	6903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250072
128	NT_187102	CCG	2	6	7010	7015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250073
129	NT_187102	GTC	2	6	7092	7097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250073
130	NT_187102	ATG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250073
131	NT_187102	AC	3	6	7157	7162	50 %	0 %	0 %	50 %	409250073
132	NT_187102	ATT	2	6	7290	7295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250073
133	NT_187102	TTG	2	6	7300	7305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250073
134	NT_187102	GT	3	6	7356	7361	0 %	50 %	50 %	0 %	409250073
135	NT_187102	CG	3	6	7570	7575	0 %	0 %	50 %	50 %	409250073
136	NT_187102	CG	3	6	7657	7662	0 %	0 %	50 %	50 %	409250073
137	NT_187102	TCA	2	6	7702	7707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250073
138	NT_187102	TGT	2	6	7726	7731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250073
139	NT_187102	GCC	2	6	7758	7763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250073
140	NT_187102	TAA	2	6	7815	7820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250073
141	NT_187102	TCT	2	6	7829	7834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250073
142	NT_187102	TTC	2	6	7866	7871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250073
143	NT_187102	AAC	2	6	7944	7949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NT_187102	CTGC	2	8	8035	8042	0 %	25 %	25 %	50 %	409250074
145	NT_187102	GCCA	2	8	8098	8105	25 %	0 %	25 %	50 %	409250074
146	NT_187102	CAT	2	6	8136	8141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250074
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149	NT_187102	GTC	2	6	8347	8352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250074
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153	NT_187102	AAT	2	6	8452	8457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250074
154	NT_187102	ATG	2	6	8495	8500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250074
155	NT_187102	GCG	2	6	8579	8584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250074
156	NT_187102	CGG	2	6	8591	8596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250074
157	NT_187102	TGC	2	6	8597	8602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250074
158	NT_187102	TGC	2	6	8732	8737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250074
159	NT_187102	CTTC	2	8	8774	8781	0 %	50 %	0 %	50 %	409250074
160	NT_187102	TTCG	2	8	8790	8797	0 %	50 %	25 %	25 %	409250074
161	NT_187102	TAT	2	6	8898	8903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250074
162	NT_187102	GC	3	6	8967	8972	0 %	0 %	50 %	50 %	409250074
163	NT_187102	GGA	2	6	8988	8993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250074
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165	NT_187102	ATT	2	6	9018	9023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250075
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175	NT_187102	TAT	2	6	9707	9712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NT_187102	CAT	2	6	9721	9726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
177	NT_187102	TTTA	2	8	9765	9772	25 %	75 %	0 %	0 %	409250076
178	NT_187102	CA	3	6	9825	9830	50 %	0 %	0 %	50 %	409250076
179	NT_187102	A	6	6	9855	9860	100 %	0 %	0 %	0 %	409250076
180	NT_187102	GCA	2	6	10008	10013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250076
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189	NT_187102	GCG	2	6	10424	10429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
190	NT_187102	GCG	2	6	10491	10496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250077
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193	NT_187102	ACC	2	6	10742	10747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250077
194	NT_187102	TAAA	2	8	10755	10762	75 %	25 %	0 %	0 %	409250077
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196	NT_187102	GCG	3	9	10771	10779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250077
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212	NT_187102	G	8	8	11733	11740	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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220	NT_187102	GCT	2	6	12334	12339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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222	NT_187102	CGC	2	6	12406	12411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250079
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251	NT_187102	CTGC	2	8	14071	14078	0 %	25 %	25 %	50 %	409250079
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261	NT_187102	CGT	2	6	14573	14578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NT_187102	ATG	2	6	14585	14590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NT_187102	AAT	2	6	14593	14598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NT_187102	TTA	2	6	14608	14613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NT_187102	ATT	2	6	14737	14742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NT_187102	TGA	2	6	14836	14841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250081
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268	NT_187102	GTT	2	6	14854	14859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250081
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296	NT_187102	AAG	2	6	16112	16117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
297	NT_187102	TAT	2	6	16130	16135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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391	NT_187102	CAT	2	6	21105	21110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250085
392	NT_187102	A	6	6	21152	21157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NT_187102	CGG	2	6	21169	21174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
394	NT_187102	GCA	2	6	21201	21206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
395	NT_187102	GCA	3	9	21274	21282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250086
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397	NT_187102	CATT	2	8	21317	21324	25 %	50 %	0 %	25 %	409250086
398	NT_187102	TCA	2	6	21336	21341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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